А. ОРГАНИЗАЦИОНЕ ЈЕДИНИЦЕ МИНИСТАРСТВА ПОЉОПРИВРЕДЕ И РУРАЛНОГ РАЗВОЈА
Организационе јединице Министарства су:
1. ДИРЕКТОРАТ ЗА ПОЉОПРИВРЕДУ
1.1. Дирекција за биљну производњу и инспекцијски надзор
1.1.1. Одсјек за биљну производњу
1.1.2. Одсјек за инспекцијски надзор
1.2. Дирекција за сточарство
1.3. Дирекција за шеме квалитета и земљишну политику
2. ДИРЕКТОРАТ ЗА РИБАРСТВО
2.1. Дирекција за управљање ресурсима и риболовном флотом
2.2. Дирекција за мониторинг и инспекцијски надзор
2.2.1.Одсјек за инспекцијски надзор
2.3. Дирекција за структурне мјере, тржиште и државну помоћ
3. ДИРЕКТОРАТ ЗА ВОДОПРИВРЕДУ
3.3. Дирекција за управљање водама
3.4. Дирекција за мониторинг и евалуацију
4. ДИРЕКТОРАТ ЗА ШУМАРСТВО, ЛОВСТВО И ДРВНУ ИНДУСТРИЈУ
4.1. Дирекција за шумарство
4.2. Дирекција за ловство
4.3. Дирекција за мониторинг у шумарству и ловству
4.4. Дирекција за дрвну индустрију
5. ДИРЕКТОРАТ ЗА ПЛАЋАЊА
5.1. Дирекција за административне послове
5.2. Дирекција за регионалну координацију
5.3. Дирекција за директну и тржишну подршку
5.4. Дирекција за структурну подршку
5.4.1. Одсјек за оглашавање и ауторизацију пројеката
5.4.2. Одсјек за ауторизацију плаћања
5.4.3. Одсјек за контролу на терену
5.5. Дирекција за рачуноводство, буџет и извршавање плаћања
5.5.1. Одсјек за рачуноводство и буџет
5.5.2. Одсјек за извршавање плаћања
5.6. Дирекција за ИТ и пољопривредне регистре
5.6.1. Одсјек за ИТ
5.6.2. Одсјек за Регистар пољопривредних газдинстава
5.6.3. Одсјек за СИЗЕП
6. ДИРЕКТОРАТ ЗА РУРАЛНИ РАЗВОЈ
6.1. Дирекција за програмирање
6.2. Дирекција за мониторинг и евалуацију ИПАРД-а
6.3. Дирекција за координацију и односе са јавношћу (ПР) руралног развоја
7. ОДЈЕЉЕЊЕ ЗА САВЈЕТОДАВНЕ ПОСЛОВЕ У БИЉНОЈ ПРОИЗВОДЊИ
8. ОДЈЕЉЕЊЕ ЗА САВЈЕТОДАВНЕ ПОСЛОВЕ У ОБЛАСТИ СТОЧАРСТВА
9. ОДЈЕЉЕЊЕ ЗА УНУТРАШЊУ РЕВИЗИЈУ
10. ОДЈЕЉЕЊЕ ЗА ЕКОНОМСКЕ АНАЛИЗЕ И ТРЖИШТЕ
11. ОДЈЕЉЕЊЕ ЗА НОРМАТИВНО ПРАВНЕ ПОСЛОВЕ МИНИСТАРСТВА
12. ОДЈЕЉЕЊЕ ЗА РАЗВОЈ, МЕЂУНАРОДНУ САРАДЊУ И ИПА ПРОЈЕКТЕ
13. КАБИНЕТ МИНИСТРА
14. СЛУЖБА ЗА ЉУДСКЕ РЕСУРСЕ И ОПШТЕ ПОСЛОВЕ
15. СЛУЖБА ЗА ФИНАНСИЈЕ, РАЧУНОВОДСТВО И ЈАВНЕ НАБАВКЕ
Органи управе над којима Министарство врши надзор
Управа за безбједност хране
Управа за воде
Управа за шуме